Las asociaciones con mayor cantidad de fondos asignados son la Fundación Ayúdame a Vivir, la Fundación Tu Sanador El Salvador, Comandos de Salvamento, Cruz Verde Salvadoreña y la Liga contra el Cáncer de El Salvador.
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Las de menor asignación, de $15,000, son tres asociaciones de comunidades con VIH-SIDA; seguidas por la Asociación de Señoras de la Caridad de Santa Tecla y la Asociación Sociedad Señoras de la Caridad San Vicente de Paúl de Cojutepeque. La asignación de subsidio en el Ministerio de Salud ha oscilado entre $4.7 millones en 2013 hasta $6.2 millones en 2024.
El gobierno presentó un presupuesto de $9,663 millones, con congelamiento de escalafones en Salud y Educación, así como recortes de un 5.4 % de sus plazas, es decir, 11,115 plazas. La asignación a las asociaciones y fundaciones se mantendría respecto a 2024, . El Ministerio de Cultura también incluye subsidios a otras entidades no detalladas por $20,000.
Si bien desde el año 2013 la cantidad de fondos destinados a las distintas fundaciones ha oscilado entre $3.7 hasta $6.2 millones en el Ministerio de Salud, en el año 2018 y 2019 otras carteras de Estado como Educación, Agricultura, Turismo y Obras Públicas también incluían presupuesto para otras entidades, así como la partida de transferencias y obligaciones. Por ejemplo, en 2018, la partida de transferencias y obligaciones generales del Estado sumó $4.2 millones para subsidios a entidades. En 2023, la asignación total para el presupuesto 2024 aumentó en $10 millones, incorporando 16 oenegés.
